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ActiveScale对象存储,帮助Genomics England扩展基因组测序工程规模 科汇科技- 四川 昆腾quantum 磁带机 官方授权分销代理商
作者:管理员    发布于:2020-10-19 16:53:00    文字:【】【】【
昆腾公司(NASDAQ: QMCO)近日宣布,通过采用昆腾的ActiveScale对象存储解决方案,英格兰基因组公司(Genomics England)成功扩展了自身的集成环境,该环境的建立,实现了对数百PB基因组数据的存储、保护和便捷访问。


ActiveScale解决方案帮助该组织将基因组测序规模从100,000个扩大到数百万个,同时实现了提高数据弹性、控制成本、避免了复杂的IT环境等等其他益处。该项目的成功实施,不但支持着英格兰基因组公司对COVID-19重症监护患者和其他病毒感染者进行基因组测序的承诺,也凸显了昆腾在存储和管理非结构化数据方面的业界优势地位。

英格兰基因组公司于2013年由英国卫生和社会福利部成立,以作为“十万基因组计划”的实施主体——目标是为了完成对大量罕见疾病和常见癌症患者的全基因组进行测序的这一项开创性的工作。2018年,该计划的规模显著扩大:新的目标是计划在五年内,对多达500万个基因组进行测序。不幸的是,现有的用于基因组数据的NAS系统无法再承担更大的容量任务了。21PB的数据,已经达到了NAS节点的扩展极限。与现有的NAS解决方案相比,英格兰基因组学公司需要一种更具可扩展性的方案——一种可以增长到数百PB容量的基础设施架构;新架构还必须做到能让遍布世界各地的3000多名研究人员简单、灵活地从中获取数据。

为了建立最适合与自身需求的存储解决方案,英格兰基因组学公司咨询了一家独立的英国数据服务组织——Nephos Technologies,在评估了市面上的多个选项之后,Nephos团队设计了一套全方位的解决方案,该解决方案完美整合了来自WekaIO的高性能并行文件系统、Mellanox®的高速网络设备和昆腾的ActiveScale对象存储系统。

该解决方案创建了一个双层架构,将全闪存储与ActiveScale对象存储系统结合在了一起,并将该对象存储系统用作长期保存数据的存储库。这两个存储层(每个层都可以独立扩展)可被视为一个单一的混合存储环境。基于此架构,研究人员们可以灵活地以高度随机化的方式完成数据查询。

在部署完新存储环境的几年之后,英格兰基因组学公司又一次面临着容量扩展的问题。原因在于,2020年初COVID-19疫情的出现,为全球的医疗科学界提出了紧迫的挑战,而英格兰基因组学公司在帮助全社会更好地了解哪一类人群更容易感染病毒方面,处于有利地位。该组织承诺,会完成对2万名COVID-19重症监护患者和1.5万名症状轻微患者的基因组测序。

为此,英格兰基因组公司把自身的ActiveScale对象存储环境,从40 PB扩展到了100 PB以上。ActiveScale系统的架构并不是以往常见的RAID结构,而是采用了智能、动态的纠删码数据分布技术。这样的数据分布方式消除了系统需要重新构建数据平衡的需求,因为重新构建系统平衡会影响到系统的性能和可用性。

ActiveScale对象存储系统不但能实现了数据的保护,也为英格兰基因组公司的关键工作提供了所需的访问灵活性。该组织通过ActiveScale的地理分布功能(这也是昆腾使用RAID替换技术的一个附加优势),可以在存储网格的多个节点之间进行数据传播和奇偶校验。通过ActiveScale对象存储,英格兰基因组公司将数据分布到了三个不同的数据中心,以便在发生重大灾难(如站点丢失)时,仍可以保证数据的完整性。在剩余的站点中,数据依然可以被继续访问并进行读写,并且能够承受额外的硬件故障,并最终提供高达19x9的数据耐久性。

有了ActiveScale对象存储,英格兰基因组公司无需再面临其以前NAS解决方案不可避免的容量限制问题。该组织能够轻松扩展目前所使用的对象存储系统,以支持更多的基因组分析工作,甚至可以在不进行重大调整的情况下,开展额外的COVID-19主题的基因组研究工作。在未来,英格兰基因组公司可以轻松地将ActiveScale对象存储与Amazon s3兼容的公有云环境进行集成,以获取更多的保护和扩展性。

新的存储环境在降低成本方面也有着不错的表现。根据Nephos的计算,英格兰基因组学公司的单个基因组的存储成本,与之前的环境相比,降低了75%。预计到2023年,该组织可以将该数字突破至96%。

上述提升,都是建立在英格兰基因组学公司IT团队在IT架构中没有增加任何复杂设备的情况下实现的。这一套全新的混合存储环境,使得来自世界各地的研究人员可以更容易地存储,并访问到他们工作上所需要用到的基因组数据。

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